В Cubic Studio есть такой инструмент, как вокселизация, работает по принципу интеграла с заданной точностью. Таки да, делает из шара кубы. Проблем применить это в конвертере я не вижу, если нужна воксельная моделька. Если нужна такая же - сделать метод, который умеет обрабатывать треугольные полигоны в obj. И кстати, в objе совершенно не обязательно, что полигон будет именно треугольным.