Если эти координаты зависят, например, от сида мира, тогда в теории вообще проблем нет. Берешь заранее подгротовленного родителя (свой слой), который проверяет влияет ли массив данных на твою точки или нет (глава Масштабирование слоев), то генеришь на этих координатах свой биом. Кинь алгоритм я...