Можно кнч. Для этого нужно при помощи AxisAlignedBB выделить область(удобно использовать expand и grow), при помощи getEntitiesWithinAABB получаешь сущностей в кубической области, полученный список фильтруешь по сферическому радиусу(если нужно), и после у всех оставшихся сущностей вызываешь setDeath()