на днях скачал мод и там была зависимость geckolib3, на сколько я понимаю по описанию, это как раз поддержка анимаций через blockbench и код.
и даже пост нашел на новые версии
Как смешать анимации в geckolib3?
также есть вики
Getting Started и от туда
Making Your Models (Blockbench)
В общем must have
Сам я использовал blender и так как разбираюсь в нём, в моделях, анимациях. Сделал экспортёр для blender и чтение потом модели в этом формате в minecraft (это был заказ, поэтому я не могу его выложить)). Анимации были не скелетными, а как в Minecraft (потому что на тот момент не знал как работать со скелеткой). Но за счёт того что количество элементов могло быть каким угодно (как замоделишь), это была неплохая альтернатива.